해군정보통신학교는 지휘정보학부, 정보통신학부, 음탐전자학부로 구성되어 있습니다.

지휘정보학부는 정보통신병과 장교교육인 초군반 및 지휘통신참모/정보통신장교 연수과정, 지휘통제체계 교육인 KNCCS 관리자 연수과정, 군 정보 보호를 위한 정보보호 연수과정 등을 교육하고 있습니다.

정보통신학부는 전공, 전산, 통신 직별 교육을 담당하며 유, 무선통신체계, 네트워크, 프로그래밍 등의 내용을 교육하고 있습니다. 부사관 보수교육 과정으로 각 직별 초·중·고급 과정이 있으며, 특기병 교육과정으로는 통신병, 전공병, 전산병과정을 교육하고 있습니다.

음탐전자학부는 음탐, 전자, 전자전 직별 교육을 담당하며 함정의 눈과 귀가 되는 음탐기와 전탐기, 적 함정 및 유도무기 등의 전자장비에 대항하는 전자전에 관한 내용을 교육하고 있습니다. 부사관 보수교육과정으로 각 직별 초·중·고급 과정 및 보직전 과정을 운영하고 있으며, 특기병 교육과정으로는 전자전병 과정을 교육하고 있습니다.